股东变更的办理主要涉及以下步骤：

一、确定变更事项并准备材料

股权变更协议：由出让方和受让方就股权的转让价格、付款方式、股权交割时间等事项进行协商并签订协议。这是整个股东变更的核心文件，明确了双方的权利和义务。例如，协议中可能会规定受让方在某个特定日期前支付全部股权转让款，出让方则在收到款项后的一定时间内完成股权交割。

公司章程修正案：因为股东变更会导致公司股权结构的改变，所以需要修改公司章程中关于股东和股权的相关条款。修改内容包括股东姓名（名称）、出资方式、出资额和出资时间等。

股东会决议：公司需要召开股东会，就股东变更事项进行表决。对于有限责任公司来说，股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东会决议需要记录会议的时间、地点、出席股东情况、决议事项等内容，并由出席股东签字（盖章）。

股东身份证明材料：提供新旧股东的身份证明文件，如自然人股东的身份证复印件、法人股东的营业执照副本复印件等。这些材料用于核实股东身份信息。

股权交割证明材料：根据股权转让的实际情况，可能需要提供股权交割的证明，如股权转让款的支付凭证、股权凭证的交接记录等。这可以证明股权的转让已经实际发生。

二、工商变更登记

提交申请材料：将准备好的上述材料，包括股权变更协议、公司章程修正案、股东会决议、股东身份证明等，一并提交给公司登记机关（通常是当地的工商行政管理部门）。许多地区现在都提供了网上申报系统，可以通过该系统上传电子材料进行申请，部分情况下可能还需要提交纸质材料进行核对。

审核：工商行政管理部门会对提交的申请材料进行审核。审核内容主要包括材料的完整性、合法性以及股权变更是否符合法律法规和公司章程的规定。例如，审核人员会检查股东会决议是否符合法定程序，股权变更协议是否存在违法违规条款等。如果材料存在问题或不符合要求，会通知申请人补充或修改材料。

领取新的营业执照（如有需要）：如果审核通过，公司登记机关会对公司的股东信息进行变更登记，并颁发新的营业执照，或者在原营业执照上注明股东变更的相关信息。

三、税务变更登记

申报税务变更：股东变更可能会涉及税务方面的问题，例如股权转让过程中的印花税、企业所得税等。公司需要在股东变更后，及时向主管税务机关申报税务变更。申报时需要提交工商变更登记证明、股权变更协议等相关材料。

缴纳相关税费：根据税务机关的核定，公司或股东需要缴纳相应的税费。例如，在股权转让中，转让方如果有所得，需要按照规定缴纳企业所得税或个人所得税；同时，双方还需要按照股权交易金额的一定比例缴纳印花税。

四、银行账户变更（如果涉及）

通知银行并准备材料：如果公司的银行账户预留了股东信息，或者股东变更影响到银行账户的权益等情况，需要通知开户银行进行账户信息变更。通常需要携带新的营业执照、公司章程修正案、法定代表人身份证明、变更后的股东身份证明以及银行要求的其他材料。

办理银行账户变更手续：银行在核实相关材料后，会对公司的银行账户信息进行变更，包括修改账户系统中的股东信息、更新预留印鉴（如果涉及）等操作。

整个股东变更过程需要严格按照法律法规和公司章程的规定进行操作，确保变更的合法性和有效性。同时，不同地区的具体办理流程和要求可能会有所差异，在办理过程中可以咨询当地的工商行政管理部门或专业的工商代办机构获取更准确的信息。