道路运输许可证延期申请被驳回可能有以下原因：

申请材料问题：

材料不齐全：例如缺少企业营业执照正副本原件及复印件、原道路运输经营许可证正副本的原件及复印件、法定代表人身份证复印件、车辆行驶证和道路运输证正反面复印件、机动车综合性能检测报告单、企业负责人和安全管理人员资格证书原件或复印件等关键材料中的一项或多项3。

材料虚假或无效：提供的材料存在伪造、篡改等情况，或者材料已过期、失效。比如营业执照未按时年检、资格证书过期等。

材料格式或内容不符合要求：填写的申请表信息不完整、不准确，或者相关证明文件的格式、内容没有按照规定的标准和要求提供。例如，申请表上的企业信息填写错误、证明文件没有加盖公章等。

企业自身条件问题：

运输车辆状况不达标：车辆的技术状况、安全性能等不符合道路运输的相关标准和要求。例如，车辆存在严重的机械故障、尾气排放不达标、未按规定进行定期维护和检测等5。

驾驶员资质不符合规定：企业所聘用的驾驶员未取得相应的机动车驾驶证、从业资格证，或者驾驶证、从业资格证已过期、被吊销、暂扣等5。

企业经营管理存在问题：企业没有健全的安全生产管理制度、运营管理混乱、存在严重的违规经营记录等。例如，企业未按照规定对驾驶员进行安全教育培训、未落实车辆动态监控管理等1。

未满足相关法规政策要求：

许可证过期时间过长：部分地区规定道路运输许可证过期后有一定的宽限期可以申请延期，但如果过期时间过长，可能会被视为自动放弃许可证，申请延期会被驳回。例如，有的地方规定许可证过期超过一定期限（如 30 天或 90 天等）后就不能再申请延期，需要重新办理4。

经营范围变更未获批：如果企业在申请延期的同时还申请了经营范围的变更，但变更申请未获得相关部门的批准，那么延期申请也可能会被驳回。

存在未处理的违法违规行为：企业在之前的经营过程中存在未处理的交通违法违规行为，如超载、超速、疲劳驾驶等，或者有未缴纳的罚款、滞纳金等，相关部门可能会驳回其延期申请，要求企业先处理完违法违规行为。

其他原因：

申请流程错误：没有按照正确的申请流程和方式提交延期申请，例如未在规定的时间内提交申请、未通过指定的渠道提交申请等。

政策调整或行业限制：由于当地交通政策的调整、行业发展规划的变化等原因，相关部门对道路运输许可证的延期申请进行了限制或暂停审批，导致申请被驳回。